截至2019年末,巢湖市共有各级医疗机构428家,其中三甲医院1家,二级以上综合医院3家,二级专科医院1家,市政府直属医疗卫生单位6家,乡镇级医疗卫生单位12家,街道社区卫生服务中心6家,村卫生室161家,社区卫生服务站25家,社会力量举办的医疗机构医院23家、门诊部19家,各类诊所154家,医务室(卫生所)17家。全市拥有卫生机构人员6260人,同比增加4.2%,其中卫生技术人员5364人,同比增长2.5%。卫生机构床位数4123张(不含卫生室、诊所观察床位数)。每千人拥有卫生技术人员5.18人。5岁以下儿童死亡率3.38‰,婴儿死亡率2.41‰,其中新生儿死亡率1.13‰,产妇住院分娩率100%。